Margarida Neta tem desenvolvido a sua atividade nas diferentes vertentes da mobilidade e acessibilidade, com enfâse para a elaboração de planos de mobilidade sustentável nos últimos quinze anos.
Atualmente encontra-se a desenvolver o Plano de Mobilidade e Transportes de Sintra. Além da elaboração dos planos, Margarida Neta tem tido a oportunidade trabalhar também na implementação concreta dos mesmos. Tem trabalhado em inúmeros projetos de política de estacionamento e integração dos modos ativos nas políticas públicas. Apresenta, igualmente, uma ampla experiência em processos de consulta pública e políticas de mobilidade urbana.

Foi responsável pela elaboração do Manual de Metodologia e Boas Práticas para a Elaboração de um Plano de Mobilidade Urbana Sustentável (no âmbito do Projeto Europeu OQR MARE, Projeto TRAMO). Foi igualmente responsável pela elaboração da coleção de onze documentos técnicos de suporte à elaboração de planos de mobilidade urbana sustentável, para a Administração Central Portuguesa (Instituto da Mobilidade e dos Transportes - IMT).

Além de sua experiência europeia (principalmente Portugal, França e Suíça), Margarida Neta tem vindo, igualmente, a trabalhar em contextos mediterrânicos e africanos (por exemplo, Angola, Gana, Marrocos, Moçambique, Senegal e Tunísia). Durante 2014-2015 desempenhou as funções de Especialista Principal em Mobilidade Urbana no âmbito do Projeto Europeu EuroMed RRU, projeto de cooperação com os países do Mediterrâneo (EuroMed Road Rail and Urban Transport), nomeadamente, Argélia, Egito, Israel, Jordânia, Líbano, Marrocos, Palestina e Tunísia.